Строительство крупной гидроэлектростанции может привести к затоплению огромных территорий, вытеснению местного населения и изменению экосистемы реки. Хотя это "зеленая" энергия, какие негативные стороны могут быть у возобновляемых источников энергии?

Здесь надо сразу оговориться и принять как данность. Не существует абсолютно "зелёных", безвредных технологий для природы. В реальности существует только выбор по принципу "больше-меньше". Вы упомянул ГЭС. Это ведь не только про изменение экосистем в моменте, это целая череда серьёзных изменений в будущем. Зарегулирование стока вызывает изменения поведения обитателей рек, серьёзно влияет на популяции рыб за счёт ухудшение условий их естественной миграции. Это могут быть сбросы теплой воды, которая используется для охлаждения турбин, что также может привести к изменению кислотности среды, ХПК и БПК и многое другое. То есть ущерб экосистеме и биорескрсам неизбежен. Примерно такой же вывод можно сделать при использовании солнечной или ветровой генерации. Важно понять, что внедрение условно "зелёной" технологии - это результат признания возможных потерь и все равно определённый эколого-экономический компромисс